Newick文字列を貼り付けるか、種のリストを入力してください。系統樹作成ツールは長方形のフィログラムを描画し、SVGまたはPNGとしてエクスポートできます。論文、プレゼンテーション、授業課題に最適です。
系統樹作成ツールは、枝長・内部ノード名・引用符付きラベルの有無を問わず、標準Newick形式を解析します。MEGA、RAxML、IQ-TREE、その他の系統解析パイプラインの出力を貼り付けると、ツリーが即座に描画されます。ファイルのアップロードも形式変換も不要です。テキストボックス1つで、1つの結果が得られます。
すべての系統樹が多重配列アラインメントから始まるわけではありません。種リストモードに切り替えて、1行に1分類群を入力または貼り付けると、系統樹作成ツールが自動的にバランスの取れたクラドグラムを構築します。教材、分類の概要、正式な解析前の簡単なビジュアルドラフトに便利です。
同じ系統樹作成ツールで作成された4つの系統樹。霊長類から細菌株まで、それぞれ異なる生命のスケールを表しています。
10種の霊長類が、分子分岐推定値を反映した比例枝長を持つ長方形フィログラムで配置されています。大型類人猿は期待どおりにクラスターを形成し、新世界ザルが外群となっています。
NextstrainがエクスポートしたNewick文字列から構築された、呼吸器ウイルス変異株のコンパクトな系統樹です。短い枝長は、RNAウイルスに典型的な急速な変異率を反映しています。
主要な被子植物の科を、種リスト入力モードを使ってクラドグラムに整理したものです。枝長なしの純粋にトポロジカルな系統樹で、植物学の講義資料に適しています。
16S rRNA遺伝子配列から構築された環境細菌分離株の系統樹です。枝の長さはサイトあたりの塩基置換数を表し、参照用のスケールバーが付いています。
系統樹は、種、遺伝子、集団などの生物学的実体間の進化的関係を表す分岐図です。各分岐点は共通祖先を表し、分岐パターンは系統が時間とともにどのように分岐してきたかに関する仮説を反映しています。系統樹は比較生物学、疫学、保全計画において中心的な役割を果たします。
系統樹は通常、最尤法、ベイズ推定、近隣結合法などの手法を用いて分子データ（DNA、RNA、またはタンパク質配列）から推定されます。結果は通常、Newick形式で保存されます。これは、トポロジーと、必要に応じて進化的距離に比例する枝の長さを符号化する、入れ子になった括弧によるテキスト表記法です。
系統樹作成ツールは、そのNewick文字列を受け取り、出版や教育に適した視覚的な図に変換します。このツールは、査読付き文献で最も一般的なレイアウトである矩形フィログラムを、オプションの枝長注釈とスケールバー付きでレンダリングします。
どちらも進化的関係を示しますが、系統樹とクラドグラムは、枝の長さが表すものと、それぞれをいつ使用すべきかが異なります。
枝の長さは進化的距離に比例
枝の長さは均一 — トポロジーのみ
生データから完成した図までの4つのステップ — ソフトウェアのインストールは不要です。
系統解析ソフトウェア（MEGA、RAxML、IQ-TREE、MrBayes）からNewick文字列をコピーして、テキストボックスに貼り付けます。手早くクラドグラムを作成したい場合は、種リストモードに切り替えて、1行に1つの分類群名を入力してください。
枝長ラベルの表示/非表示を切り替え、葉名のフォントサイズを設定します。プレビューはリアルタイムで更新されるため、再エクスポートせずに試行錯誤できます。
入力パネルの右側に長方形フィログラムが表示されます。系統樹に多くの分類群が含まれる場合はスクロールしてください。表示されている内容がそのままエクスポートに含まれます。想定外のことはありません。
「SVGをダウンロード」をクリックすると、IllustratorやInkscapeで編集できるベクターファイルを取得できます。「PNGをダウンロード」をクリックすると、スライド、ポスター、補足資料にそのまま使える2倍解像度のラスター画像を取得できます。
系統樹と、このツールを使った系統樹の作成方法に関するよくある質問です。
Newick文字列を貼り付けるか、種のリストを入力し、表示を調整して、出版対応の系統樹をダウンロードできます。インストールもサインアップも不要です。
