樹形図作成ツール

デンドログラムとは、階層クラスタリングの過程で項目が結合された順序と高さを記録する樹形図です。枝の長さに意味を持たないクラドグラムとは異なり、デンドログラムの枝の高さは実際のデータです——2つのクラスターが結合したときの距離や非類似度を表し、ラベル付きの軸から直接読み取れます。

デンドログラムが実際に何を示すかは、2つの選択で決まります。1つ目は距離指標です——ユークリッド距離、相関距離、コサイン距離などはそれぞれ「類似」の定義が異なるため、同じ生データでも指標次第で結合高さが変わります。2つ目は連結法です——平均連結法はクラスター間の平均ペア距離で結合し、単一連結法は最も近いペアで結合します（中間点を介して離れた点同士を鎖状につなぐことがあります）、完全連結法は最も遠いペアで結合します（密で均等な大きさのクラスターになりやすい）。指標や連結法のどちらかを変えるだけで、デンドログラム上でどのグループが自然に見えるかが変わるため、両方の選択は手法セクションに明記すべきであり、ソフトウェアの初期設定に任せるべきではありません。

デンドログラムができたら、選んだ距離閾値に水平なカットラインを引くことで、連続的な結合構造を離散的なクラスター数に変換できます——低い位置で切れば多く細かいクラスターに、高い位置で切れば少なく大まかなクラスターになります。これはクラスター分析において根拠なく数を主張するのではなく、特定のクラスター数を裏付ける標準的な方法です。