インデント付きアウトラインまたは括弧記法でタクサを入力すると、このクラドグラム作成ツールが末端を揃えた階段状のクラドグラム（分岐図）を描画します。生物の授業や論文で使われる形式で、SVGまたはPNGとして書き出せます。
このクラドグラム作成ツールで描いた4つの分岐図。分岐順序が共通祖先の関係をどう表すかを示しています。
魚類、両生類、爬虫類、哺乳類を四肢、羊膜卵、体毛といった共有派生形質で分類し、それぞれの形質が最初に現れた分岐点に注記しています。
植物学の授業向けに、推定される分岐順序で被子植物の科を分類したクラドグラム。分子データなしで単純なインデントアウトラインから作成できます。
獣脚類・竜脚類・鳥盤類を分ける教科書スタイルのクラドグラム。講義ノートの括弧記法をそのまま貼り付けて作成しています。
類人猿と初期人類をまとめたコンパクトなクラドグラム。枝の長さに意味がないため、すべての末端は右端に揃えています。
クラドグラムとは、ある生物群の間で推定される共通祖先の関係を示す分岐図であり、時間や進化的変化の量については何も主張しません。各分岐点（ノード）は仮説上の共通祖先を表し、その右側にあるすべての系統は、それ以外の生物には見られない派生形質——共有派生形質（シナポモルフィー）——を共有しています。
初めてこの言葉に触れる人が最も混同しやすいのがこの点です。クラドグラムでは枝の長さに意味がありません。遠く離れて描かれた2つの末端と近くに描かれた2つの末端は、同じ分岐の深さにあれば、系統的な近さは等しいということです。これは系統樹（フィログラム）とは異なります——系統樹では枝の長さが分子的な距離や分岐年代に比例して描かれます。そのためクラドグラム作成ツールは、スケールバーに合わせて枝を伸縮させるのではなく、すべての末端を同じ端に揃えた階段状のレイアウトで描画します。
クラドグラムは形態的形質、行動、あるいは現代の実践では分子配列データを最節約法や最尤法で単純化したトポロジーをもとに構築されます。この図はトポロジーのみを符号化するため、系統分類学（クラディスティクス）——全体的な類似度ではなく共有派生形質によって生物を分類する手法——を教える際の標準的な図として使われ、その後に枝長を持つ系統樹へと進みます。
タクサのリストから書き出し可能な図まで、4ステップ——描画ソフト不要です。
インデントアウトライン（1行に1タクソン、深いインデントほど派生的な分岐を意味）を入力するか、(Fish,(Amphibians,Mammals)) のような括弧記法を貼り付けます。手元の資料に近い方を選んでください。
タクソン名の後に角括弧で共有形質を追加します——例：Amniotes [羊膜卵]——すると、その分岐点に小さな目盛りとラベルが描かれます。
入力するたびに図が更新され、すべての末端が同じ端に揃います。分岐の位置がずれていたら、行のインデントを直すか括弧グループを移動するだけで修正できます——座標をドラッグする必要はありません。
IllustratorやInkscapeでラベルを編集できるベクター形式のSVG、またはスライドや配布資料、レポート用の2倍解像度PNGをダウンロードできます。
この2つの図は似ていますが、両者を分けるのはただ一点——枝の長さが情報を持つかどうか——であり、これが読み方を決定します。
枝の長さに意味はなく、トポロジーのみを表す
枝の長さが進化的距離に比例する
多くの学生や教員は入れ子の括弧ではなくアウトラインで考えます。1行に1タクソンを入力し、インデントで祖先の下に分岐をネストするだけ——クラドグラム作成ツールはインデントだけから木構造を推測するので、講義ノートのアウトラインを整形し直さずそのまま図にできます。
深く入れ子になった、あるいはコピー＆ペーストしたトポロジーには、アウトラインより括弧記法の方が速く書けます。クラドグラム作成ツールは標準的な入れ子括弧のグループ化を解析します——クラドグラムでは使わないため、枝長構文について心配する必要はありません。
クラドグラムが教育で役立つのは、系統がなぜグループ化されたのかを示す場合です。任意のノードに四肢、羊膜卵、羽毛といった共有派生形質を付けると、クラドグラム作成ツールはその形質が最初に現れたはずの分岐点に、注釈付きの小さな目盛りを描画します。
クラドグラムとこのツールでの作成方法に関するよくある質問です。
インストール不要、ファイル変換も不要——タクサを入力するだけで、レポートや講義スライドに使える図をダウンロードできます。
