Saisissez une liste indentée de taxons ou collez une notation entre crochets, et ce créateur de cladogramme dessine un diagramme en angles droits avec chaque extrémité alignée — la mise en page attendue en cours de biologie, prête à exporter en SVG ou PNG.
Quatre cladogrammes construits avec cet outil, chacun montrant une manière différente dont l'ordre de ramification communique une ascendance commune.
Poissons, amphibiens, reptiles et mammifères classés selon des caractères dérivés partagés — quatre membres, l'œuf amniotique, les poils — chacun marqué au nœud où il apparaît pour la première fois.
Un cladogramme de cours de botanique regroupant les familles d'angiospermes selon un ordre de ramification déduit, construit à partir d'un simple plan indenté, sans donnée moléculaire requise.
Un cladogramme de style manuel séparant théropodes, sauropodes et ornithischiens, dessiné à partir d'une notation entre crochets collée directement depuis des notes de cours.
Un cladogramme compact des grands singes et des premiers hominines, toutes les extrémités alignées sur le bord droit puisque la longueur des branches n'a ici aucune signification.
Un cladogramme est un diagramme ramifié qui montre le schéma déduit d'ascendance commune au sein d'un groupe d'organismes, sans rien affirmer sur le temps ou le changement évolutif qui les sépare. Chaque nœud représente un ancêtre commun hypothétique, et tout ce qui se trouve à droite de ce nœud partage un caractère dérivé — une synapomorphie — que les organismes hors du groupe n'ont pas.
C'est le détail qui déroute le plus souvent au premier contact avec le terme : dans un cladogramme, la longueur des branches n'a pas de signification. Deux extrémités dessinées loin l'une de l'autre et deux extrémités dessinées proches peuvent être également apparentées si elles se situent à la même profondeur de ramification. C'est différent d'un arbre phylogénétique (phylogramme), où la longueur des branches est proportionnelle à la distance moléculaire ou au temps de divergence. Un créateur de cladogramme aligne donc chaque extrémité sur le même bord — une mise en page en angles droits, en escalier — plutôt que d'étirer les branches selon une échelle.
Les cladogrammes sont construits à partir de caractères : traits morphologiques, comportements, ou dans la pratique moderne, données de séquence moléculaire réduites à une topologie de parcimonie stricte ou de maximum de vraisemblance. Comme le diagramme n'encode que la topologie, c'est le format pédagogique standard pour introduire la cladistique — la méthode qui regroupe les organismes par caractères dérivés partagés plutôt que par similarité globale — avant de passer aux phylogénies à longueur de branche.
Quatre étapes pour passer d'une liste de taxons à un diagramme exportable — sans logiciel de dessin.
Saisissez un plan indenté (un taxon par ligne, une indentation plus profonde indique une branche plus dérivée) ou collez une notation entre crochets telle que (Poissons,(Amphibiens,Mammifères)). Choisissez celui qui correspond à la façon dont votre source est déjà écrite.
Ajoutez un caractère partagé entre crochets après le nom d'un taxon — par exemple, Amniotes [Œuf amniotique] — et le créateur de cladogramme dessine un petit trait et une étiquette à ce nœud.
Le diagramme se met à jour au fil de la saisie, avec chaque extrémité alignée sur le même bord. Corrigez un clade mal placé en réindentant une ligne ou en déplaçant un groupe de crochets — aucune coordonnée à déplacer.
Téléchargez un SVG pour un fichier vectoriel réétiquetable dans Illustrator ou Inkscape, ou un PNG en 2× dimensionné pour les présentations, les polycopiés et les rapports de laboratoire.
Les deux diagrammes se ressemblent, mais ce qui les distingue, c'est que la longueur des branches porte ou non une information — et cela change la façon de les lire.
La longueur des branches n'a aucune signification — seule la topologie compte
Longueur des branches proportionnelle à la distance évolutive
La plupart des étudiants et enseignants ne pensent pas en parenthèses imbriquées — ils pensent en plans. Saisissez un taxon par ligne et indentez pour imbriquer une branche sous son ancêtre ; le créateur de cladogramme déduit la structure de l'arbre à partir de la seule indentation, si bien qu'un plan de notes de cours devient un diagramme sans reformatage.
Pour des topologies profondément imbriquées ou copiées-collées, la notation entre crochets s'écrit plus vite qu'un plan. Le créateur de cladogramme interprète le regroupement standard par parenthèses imbriquées — aucune syntaxe de longueur de branche à gérer, puisqu'un cladogramme n'en utilise pas.
Un cladogramme n'est utile pour l'enseignement que s'il montre pourquoi les lignées ont été regroupées. Associez un caractère dérivé partagé à n'importe quel nœud — quatre membres, un œuf amniotique, des plumes — et le créateur de cladogramme le représente par un petit trait avec une légende, exactement là où le caractère serait apparu en premier.
Questions courantes sur les cladogrammes et sur la façon d'en construire un avec cet outil.
Aucune installation, aucune conversion de fichier — saisissez vos taxons et téléchargez un diagramme prêt pour un rapport de laboratoire ou une diapositive de cours.