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系统发育树生成器

粘贴 Newick 字符串或逐行输入物种名称,系统发育树生成器即时渲染矩形系统图,可导出 SVG 或 PNG——适用于论文投稿、课堂教学和学术演示。

粘贴 Newick 字符串或输入物种名称,预览系统发育树
01FEATURES
Newick 格式输入框与实时系统发育树预览
NEWICK

支持标准 Newick 格式,粘贴即生成系统发育树

系统发育树生成器兼容标准 Newick 格式——支持带分支长度、不带分支长度、含内部节点名称、带引号标签等多种写法。从 MEGA、RAxML、IQ-TREE 等软件复制输出,粘贴即可渲染,无需上传文件或转换格式。

物种列表输入模式自动生成的平衡系统发育树
SPECIES LIST

物种列表模式:输入名称即可构建进化树

不是每棵进化树都需要从多序列比对开始。切换到物种列表模式,每行输入一个分类单元,系统发育树生成器自动构建平衡分支图。适合教学材料、分类概览和正式分析前的可视化草稿。

系统发育树下方的 SVG 和 PNG 导出按钮
SVG · PNG

导出可直接投稿的系统发育树:SVG 与 PNG

每棵生成的树都是矢量图形:任意缩放不失真,可在 Illustrator 或 Inkscape 中编辑,符合期刊图表规范。下载 SVG 获得无损矢量文件,或下载 2 倍分辨率的 PNG 用于幻灯片和海报。

浏览器地址栏显示免费在线系统发育树生成器
FREE

免费系统发育树生成器——无需安装,无需账号

系统发育树生成器完全在浏览器中运行,数据不会离开本机,无需安装任何软件,也不需要注册账号。收藏页面即可随时使用——无论在实验室、教室还是审稿过程中。

02EXAMPLES

系统发育树生成器示例:跨越不同生物学领域

同一个系统发育树生成器产出的四棵树,分别覆盖灵长类物种、病毒变体、被子植物和细菌菌株。

灵长类物种系统图

十种灵长类动物的矩形系统图,分支长度按分子分歧估计值等比绘制。类人猿聚类符合预期,新大陆猴作为外群。

病毒变体进化树

用 Nextstrain 导出的 Newick 字符串构建的呼吸道病毒变体系统发育树。短分支长度反映了 RNA 病毒的高突变速率。

被子植物科级分类图

使用物种列表模式整理的主要被子植物科分支图。纯拓扑结构、不含分支长度,适合植物学讲义。

细菌 16S rRNA 系统发育树

基于 16S rRNA 基因序列构建的环境细菌分离株系统发育树。分支长度对应每位点核苷酸替换数,底部附有比例尺。

03WHAT IS IT

什么是系统发育树?

系统发育树(phylogenetic tree)是一种用分支图描述生物实体——物种、基因或种群——之间进化关系的图表。每个分叉代表一个共同祖先,分支模式反映谱系随时间分化的假说。系统发育树是比较生物学、流行病学和保护生物学的核心工具。

进化树通常从分子数据(DNA、RNA 或蛋白质序列)推断而来,常用方法包括最大似然法、贝叶斯推断和邻接法。推断结果一般保存为 Newick 格式——一种用嵌套括号编码拓扑结构的纯文本表示法,可选附带与进化距离成比例的分支长度。

系统发育树生成器将 Newick 字符串转换为可用于发表或教学的可视化图表。本工具渲染矩形系统图——同行评审论文中最常见的布局——并可选显示分支长度标注和比例尺。

手绘风格的系统发育树草图,展示分支进化关系
04COMPARE

系统发育树 vs. 分支图(Cladogram)

两者都展示进化关系,但系统发育树和分支图在分支长度的含义以及适用场景上有所不同。

系统发育树(Phylogram)

分支长度与进化距离成比例

  • 分支长度编码每位点替换数或分歧时间
  • 附有比例尺,可进行定量比较
  • 最大似然、贝叶斯、距离法的标准输出
  • 分子系统学和基因组学论文的首选格式
  • 需要序列数据和比对结果

分支图(Cladogram)

分支长度一致——仅表示拓扑关系

  • 所有分支等长绘制,不反映进化距离
  • 仅关注分支事件的先后顺序
  • 常用于基于形态学或简约法的分析
  • 教材和教学插图中较为常见
  • 可由物种列表直接构建,无需分子数据
05HOW IT WORKS

如何用系统发育树生成器创建进化树

四个步骤,从原始数据到成品图表——无需安装任何软件。

  1. 01

    粘贴 Newick 字符串或输入物种名称

    从系统发育分析软件(MEGA、RAxML、IQ-TREE、MrBayes)复制 Newick 字符串,粘贴到文本框中。如果只需要快速分支图,切换到物种列表模式,每行输入一个分类单元即可。

  2. 02

    调整显示选项

    按需开关分支长度标签,设置叶节点名称的字号。预览实时更新,可反复调整而无需重新导出。

  3. 03

    预览系统发育树

    矩形系统图出现在输入面板右侧。分类单元较多时可滚动查看。预览与导出完全一致——所见即所得。

  4. 04

    导出为 SVG 或 PNG

    点击「下载 SVG」获取可在 Illustrator 或 Inkscape 中编辑的矢量文件。点击「下载 PNG」获取 2 倍分辨率的位图,适用于幻灯片、海报或补充材料。

06FAQ

系统发育树生成器——常见问题

关于系统发育树及本工具使用的常见问题解答。

07RELATED TOOLS

系统发育树,即刻生成

粘贴 Newick 字符串或输入物种列表,调整显示选项,下载可直接用于论文的系统发育树——无需安装,无需注册。

生成系统发育树