Figwise

火山图在线生成器

粘贴差异表达分析结果,设定显著性阈值,即可下载可发表水准的火山图。所有运算都在浏览器中完成,数据不会上传至任何服务器。

Paste your data above to generate a volcano plot
01WHAT IS IT

什么是火山图(Volcano Plot),为什么要用这个生成器

火山图是一种散点图,用于同时展示统计显著性和生物学效应量:横轴是 log₂ fold change(倍数变化的对数),纵轴是 −log₁₀ p 值。落在图表上方两角的点代表既有显著统计学意义、又具有较大变化幅度的基因或蛋白,是后续实验验证的优先候选。

火山图广泛应用于基因组学、蛋白质组学和代谢组学领域。相比逐行扫描差异表达表格,研究者通过火山图可以一眼识别上调和下调的特征分子。Nature Methods、Bioinformatics 等顶刊经常发表火山图,因为它在一张图里同时呈现了变化幅度与置信度两个关键维度。

本火山图生成器完全在浏览器端运行。粘贴包含基因名、log₂ fold change 和 p 值的表格,工具会自动识别 CSV 或 TSV 格式,实时渲染图表,并支持导出矢量 SVG 或高分辨率 PNG,可直接用于论文投稿。无需安装、无需注册,数据始终留在你的设备上。

带基因标注的火山图,显示上调和下调基因的显著性阈值
02EXAMPLES

不同研究领域的火山图生成器示例

同一个火山图生成器可以处理来自 RNA-seq、蛋白质组学、代谢组学和单细胞测序的数据。以下示例展示了在不同数据规模和分布下,显著性阈值和基因标注如何自动适配。

RNA-Seq 差异基因表达分析

经典的 bulk RNA-seq 处理组 vs 对照组比较,DESeq2 输出结果直接粘贴至火山图生成器。红色和蓝色聚类清晰呈现差异表达基因在 fold change 和 p 值阈值之上的分布。

蛋白质组学质谱数据

来自无标记定量蛋白质组学质谱实验的数据。虽然特征数量少于转录组,但火山图仍能一目了然地将显著命中与背景噪声分开。

代谢组学通路分析

使用校正后 p 值(FDR)的非靶向代谢组学比较。火山图生成器支持 p_adj 或 FDR 列,并自动渲染与所提供指标匹配的阈值线。

单细胞 RNA-Seq 差异基因

单细胞 RNA-seq 细胞群比较的标志基因通过火山图生成器可视化。面对数千个特征和极小的 p 值,工具会自动调整 y 轴范围,仅标注最显著的基因。

03HOW IT WORKS

如何用这个生成器创建火山图

从原始差异表达数据到可直接放入论文的图表只需四步。火山图生成器自动完成列检测、坐标缩放和图形渲染。

  1. 01

    粘贴差异表达数据

    从分析工具复制表格——DESeq2、limma、edgeR 或任何能输出基因名、log₂ fold change 和 p 值的流程。火山图生成器支持 TSV 和 CSV 格式,能自动识别 gene、log2fc、padj、fdr 等常见列名。

  2. 02

    设置显著性阈值

    调整 fold change 阈值(默认 |log₂FC| > 1,即两倍变化)和 p 值阈值(默认 0.05)。虚线阈值线随参数实时更新,直观显示哪些特征符合你的筛选标准。

  3. 03

    预览火山图

    图表在你修改阈值或数据时即时渲染。上调特征显示为红色,下调为蓝色,不显著的为灰色。生成器默认标注显著性最高的基因名——可调整标注数量来显示更多或更少。

  4. 04

    导出 SVG 或 PNG

    点击「下载 SVG」获取可在 Illustrator 或 Inkscape 中编辑的矢量文件,或点击「下载 PNG」获取 2 倍分辨率的位图用于论文投稿。两种格式均与屏幕上的预览完全一致。

04FEATURES
火山图生成器数据输入面板,显示自动检测到的 CSV 列名
CSV · TSV

自动识别 CSV 和 TSV 列名

粘贴 DESeq2、limma、edgeR 或其他差异表达分析流程的输出。火山图生成器能自动识别 gene、log2FoldChange、padj、FDR 等常见列名并完成映射,无需手动调整数据格式。

火山图生成器的交互式阈值控制面板,展示实时颜色变化
INTERACTIVE

交互式 Fold Change 与 P 值阈值

调整显著性阈值,火山图实时更新。数据点在不同颜色分类之间即时切换,让你无需重新运行分析流程就能探索不同的筛选严格度。

火山图生成器的 SVG 和 PNG 导出选项并排展示
SVG · PNG

可发表水准的 SVG 和 PNG 导出

下载矢量 SVG 文件用于海报或幻灯片演示,或下载 2 倍分辨率 PNG 以满足期刊的分辨率要求。导出图形与屏幕预览完全一致——所见即所得。

浏览器中运行的火山图生成器,无需登录、无水印
FREE

免费火山图生成器——无需账号、无水印

本火山图生成器的全部功能完全免费,没有注册门槛,导出的图片也没有水印。你的数据留在浏览器中,不会上传至任何服务器。

05FAQ

火山图生成器——常见问题

关于火山图和本生成工具,研究者最常问到的问题。

06COMPARE

火山图 vs. MA 图——选择合适的可视化方式

火山图和 MA 图都能可视化差异表达结果,但侧重点不同。根据你要传达的信息选择合适的图表类型。

火山图(Volcano Plot)

在一张图中同时展示效应量和统计显著性

  • 横轴:log₂ fold change;纵轴:−log₁₀ p 值
  • 一目了然地呈现上调和下调的显著命中
  • 阈值线直观分隔显著与非显著特征
  • 解读直观:上方两角 = 显著候选
  • 差异表达图表中期刊最常采用的格式

MA 图

展示 fold change 与平均表达水平的关系

  • 横轴:平均表达量 (A);纵轴:log₂ fold change (M)
  • 揭示 fold change 估计中的表达水平偏差
  • 适合质控——检查标准化是否消除了系统性趋势
  • 不在坐标轴上直接编码统计显著性
  • 更常出现在方法学论文和补充材料中
07RELATED TOOLS

准备好创建你的火山图了吗?

粘贴数据,设定阈值,下载可发表的图表——全部在浏览器中完成。

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