Une palette de couleurs pour figures scientifiques ne devrait pas exiger un diplôme de design. Construisez des jeux catégoriels, séquentiels ou divergents à partir d'Okabe-Ito, viridis, cividis et ColorBrewer, puis vérifiez chaque couleur pour la deutéranopie et la protanopie avant qu'elle n'atteigne un relecteur.
Les palettes catégorielles (qualitatives) attribuent une teinte distincte à chaque groupe de vos données — bras de traitement, types cellulaires, espèces, conditions expérimentales — l'objectif étant de distinguer des classes, pas de suggérer un ordre ou une magnitude. Un bon jeu catégoriel reste visuellement distinct au premier coup d'œil, même pour un lecteur atteint de déficience de la vision des couleurs rouge-vert, et se sépare encore nettement une fois le manuscrit imprimé en niveaux de gris par un relecteur. Okabe-Ito, conçue spécifiquement pour un design universel des couleurs, et Set2 de ColorBrewer sont les deux jeux catégoriels intégrés à ce générateur de palette scientifique — chacun constitue aussi, à lui seul, une palette accessible aux daltoniens.
Les palettes séquentielles encodent une quantité ordonnée unique — niveau d'expression, valeur p, concentration, temps écoulé — sous forme d'un dégradé lisse du faible au fort, généralement du clair au foncé. Elles conviennent aux cartes de chaleur, aux graphiques de densité, et à toute figure où la couleur ne représente qu'une magnitude. Viridis et cividis sont perceptuellement uniformes : des écarts égaux dans les données produisent des écarts d'apparence égale en couleur, si bien que l'œil ne se trompe pas sur l'endroit où un dégradé varie le plus vite. ColorBrewer Blues, un jeu séquentiel monochrome de ce générateur de palette scientifique, remplit la même fonction avec une gamme plus simple.
Les palettes divergentes conviennent aux données possédant un centre significatif — variation nulle, référence témoin, absence de corrélation — avec deux directions qui s'en écartent. Cartes de chaleur de log2 fold-change, matrices de corrélation et graphiques de taille d'effet appellent tous un schéma divergent, pour que le lecteur distingue « au-dessus de la référence » de « en dessous » par la teinte plutôt qu'en scrutant les valeurs des axes. RdBu de ColorBrewer garde le rouge et le bleu à des pôles opposés autour d'un point médian neutre, et résiste mieux à l'impression en niveaux de gris qu'une paire rouge-vert.
Chaque carte ci-dessous est le SVG exact que ce générateur de palette scientifique produit avec ses réglages par défaut — pas une maquette.
Huit teintes universelles qui forment aussi une palette accessible aux daltoniens pour les bras de traitement, lignées cellulaires ou étiquettes d'espèces — distinctes en deutéranopie et en protanopie, et encore séparables imprimées en noir et blanc.
Un dégradé perceptuellement uniforme du violet foncé au jaune, ré-échantillonné de 2 à 12 paliers pour les cartes de chaleur et graphiques de densité où la couleur encode une magnitude.
Du rouge au bleu avec un point médian neutre, pour les cartes de chaleur de fold-change et les matrices de corrélation où le lecteur doit voir quelles valeurs se situent au-dessus ou en dessous d'une référence.
La même palette rendue telle qu'elle apparaît avec une vision typique, puis transformée pour la deutéranopie et la protanopie, pour repérer une collision avant qu'un relecteur ne le fasse.
Basculez entre catégorielle, séquentielle et divergente sans quitter la page — choisissez la famille adaptée au sens réel de vos données, puis obtenez un jeu complet de couleurs de figure scientifique construit autour.
Environ 1 homme sur 12 et 1 femme sur 200 présentent une forme de déficience de la vision des couleurs rouge-vert. Cette vérification de palette accessible aux daltoniens applique une vraie transformation deutéranopie et protanopie à vos couleurs choisies et affiche les trois versions côte à côte avant même d'ouvrir votre logiciel de traçage.
Faites glisser de 2 à 12 couleurs : ce générateur de palette scientifique ré-échantillonne à partir des points de référence de chaque palette — les jeux catégoriels parcourent leurs teintes fixes, les jeux séquentiels et divergents interpolent de nouveaux paliers — sans jamais ajuster un dégradé à l'œil.
Téléchargez un SVG ou PNG étiqueté pour une légende de figure, ou cliquez sur un nuancier pour copier son code hexadécimal et coller ces couleurs de figure scientifique directement dans matplotlib, ggplot2 ou Prism — sans sélecteur de couleur séparé.
La colormap arc-en-ciel ou jet, par défaut dans les anciens logiciels de traçage, apparaît encore dans des manuscrits soumis, et comme palette de couleurs pour figures scientifiques elle échoue de deux façons précises et bien documentées.
Questions fréquentes des chercheurs préparant des figures pour une soumission à une revue.
Choisissez une famille de palette dans ce générateur de palette de couleurs scientifique, vérifiez-la pour la deutéranopie et la protanopie, et copiez les codes hexadécimaux directement dans votre script de traçage — construire une palette accessible aux daltoniens prend quelques minutes, pas un tour de plus de commentaires de relecteurs.