Pega tus resultados de expresión diferencial, establece los umbrales de significancia y descarga un volcano plot listo para publicar. Funciona completamente en tu navegador: tus datos nunca salen de tu dispositivo.
Un volcano plot es un gráfico de dispersión que representa la significación estadística frente al tamaño del efecto biológico. El eje horizontal muestra el log₂ del cambio de expresión, mientras que el eje vertical muestra el −log₁₀ p-value. Los puntos que se sitúan en las esquinas superiores representan genes —o proteínas, metabolitos u otras características— que están a la vez fuertemente alterados y son estadísticamente significativos, lo que los convierte en candidatos principales para experimentos de seguimiento.
Los investigadores de genómica, proteómica y metabolómica recurren a los volcano plots para examinar miles de comparaciones de un vistazo. En lugar de revisar una hoja de cálculo fila por fila, puedes identificar al instante las características reguladas al alza y a la baja por su posición en el gráfico. Revistas como Nature Methods y Bioinformatics publican habitualmente figuras en este formato porque reúne dos dimensiones críticas —la magnitud y la confianza— en una única vista intuitiva.
Este generador de volcano plots funciona íntegramente en tu navegador. Pega una tabla de nombres de genes, log₂ de los cambios de expresión y p-values; la herramienta analiza CSV o TSV automáticamente, representa el gráfico en tiempo real y te permite exportar un SVG vectorial o un PNG de alta resolución apto para el envío a revistas. No hay nada que instalar, no hay que crear ninguna cuenta y tus datos nunca salen de tu equipo.
El mismo generador de volcano plots procesa datos de experimentos de RNA-seq, proteómica, metabolómica y célula única. Cada ejemplo siguiente utiliza un conjunto de datos diferente para mostrar cómo los umbrales de significación y el etiquetado se adaptan a escalas y distribuciones variadas.
Una comparación clásica de RNA-seq en masa entre grupos de tratamiento y control, con la salida de DESeq2 pegada directamente en el generador de volcano plots. Los grupos rojo y azul resaltan decenas de genes con expresión diferencial por encima de los umbrales de cambio de expresión y p-value.
Datos de proteómica cuantitativa sin marcaje de un experimento de espectrometría de masas. Menos características totales que un transcriptoma, pero el volcano plot sigue separando los resultados significativos del ruido de fondo de un vistazo.
Comparación de metabolómica no dirigida mediante valores p ajustados (FDR). El generador de volcano plots acepta columnas p_adj o FDR y dibuja líneas de umbral que coinciden con la métrica que proporciones.
Genes marcadores de una comparación de clústeres de RNA-seq de célula única analizados con el generador de volcano plots. Con miles de características y valores p muy pequeños, la herramienta escala automáticamente el eje Y y etiqueta solo los resultados más significativos.
Cuatro pasos desde los datos brutos de expresión diferencial hasta una figura que puedes insertar en tu manuscrito. El generador de volcano plots se encarga automáticamente de la detección de columnas, el escalado y el renderizado.
Copia una tabla de tu herramienta de análisis — DESeq2, limma, edgeR o cualquier pipeline que genere nombres de genes con cambios de expresión (log₂ fold change) y valores p. El generador de volcano plots acepta TSV y CSV, y detecta automáticamente encabezados de columna comunes como gene, log2fc, padj y fdr.
Ajusta el punto de corte del cambio de expresión (por defecto |log₂FC| > 1, es decir, un cambio de dos veces) y el punto de corte del valor p (por defecto 0.05). Las líneas de umbral discontinuas se actualizan en tiempo real para que veas exactamente qué características cumplen tus criterios.
El gráfico se renderiza al instante mientras cambias los umbrales o los datos. Las características reguladas al alza aparecen en rojo, las reguladas a la baja en azul y las no significativas en gris. El generador etiqueta los genes más significativos: ajusta el número de etiquetas para mostrar más o menos nombres.
Haz clic en Descargar SVG para obtener un archivo vectorial sin pérdida editable en Illustrator o Inkscape, o en Descargar PNG para obtener un mapa de bits a resolución 2× listo para enviar a una revista. Ambos formatos conservan el diseño exacto que ves en pantalla.
Pega los resultados de DESeq2, limma, edgeR o cualquier pipeline de expresión diferencial. El generador de volcano plots reconoce nombres de columna comunes — gene, log2FoldChange, padj, FDR — y los asigna automáticamente, para que nunca tengas que reformatear tus datos.
Arrastra los umbrales de significancia y observa cómo el volcano plot se actualiza en tiempo real. Los puntos cambian instantáneamente entre categorías de colores, lo que te permite explorar diferentes niveles de rigor sin volver a ejecutar tu flujo de análisis.
Respuestas a las preguntas más frecuentes que los investigadores se hacen sobre los volcano plots y esta herramienta generadora.
Tanto los volcano plots como los MA plots visualizan resultados de expresión diferencial, pero enfatizan diferentes aspectos de los datos. Elige el formato que mejor se adapte a lo que quieres comunicar.
Combina el tamaño del efecto y la significancia estadística en una sola vista.
Muestra el cambio de pliegue en función del nivel de expresión medio.
Pega tus datos, define tus umbrales y descarga una figura lista para publicar — todo en tu navegador.