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계통수 생성기

Newick 문자열을 붙여넣거나 종 목록을 입력하세요. 계통수 생성기는 직사각형 계통도를 렌더링하며, SVG 또는 PNG로 내보낼 수 있습니다 — 저널, 프레젠테이션, 과제에 바로 사용할 수 있습니다.

Newick 문자열을 붙여넣거나 종 이름을 입력하여 계통수를 미리 보세요
01기능

계통수 생성기로 들어가는 두 가지 방법

계통수 생성기의 Newick 형식 입력란과 파싱된 미리보기
NEWICK

계통수 생성기에 표준 Newick 표기법 붙여넣기

계통수 생성기는 표준 Newick 형식을 파싱합니다. 가지 길이, 내부 노드 이름, 따옴표로 묶인 라벨이 있거나 없어도 됩니다. MEGA, RAxML, IQ-TREE 또는 모든 계통학 파이프라인의 출력을 붙여넣으면 트리가 즉시 렌더링됩니다. 파일 업로드도, 형식 변환도 필요 없습니다. 텍스트 상자 하나면 결과가 나옵니다.

균형 잡힌 계통수를 생성하는 종 목록 입력 모드
종 목록

간단한 종 목록으로 계통수 만들기

모든 트리가 다중 서열 정렬에서 시작하는 것은 아닙니다. 종 목록 모드로 전환하여 한 줄에 하나의 분류군을 입력하거나 붙여넣으면 계통수 생성기가 자동으로 균형 잡힌 분지도를 만듭니다. 교재 자료, 분류 개요, 공식 분석 전 빠른 시각적 초안에 유용합니다.

02예시

생물학 분야별 계통수 생성기 예시

동일한 계통수 생성기로 만든 네 개의 트리로, 각각 영장류 종에서 세균 균주에 이르기까지 생명의 다양한 규모를 나타냅니다.

영장류 종 분지도

10종의 영장류가 분자적 분기 추정치를 반영한 비례적 가지 길이를 가진 직사각형 계통도로 배열되어 있습니다. 유인원이 예상대로 무리를 이루고, 신세계원숭이가 외군(outgroup)으로 표시됩니다.

바이러스 변이 계통수

Nextstrain에서 내보낸 Newick 문자열로 만든 호흡기 바이러스 변이체의 간결한 계통수입니다. 짧은 가지 길이는 RNA 바이러스의 전형적인 빠른 돌연변이율을 반영합니다.

속씨식물 과 분류

주요 속씨식물 과들이 종 목록 입력 모드를 사용하여 분지도로 정리되어 있습니다. 가지 길이가 없고 순수하게 위상적이어서 식물학 강의 유인물로 적합합니다.

세균 16S rRNA 계통수

16S rRNA 유전자 서열로 구축한 환경 세균 분리주의 계통수입니다. 가지 길이는 부위당 뉴클레오타이드 치환 수를 나타내며, 참조용 축척 막대가 포함됩니다.

03개요

계통수란 무엇인가?

계통수는 종, 유전자, 집단과 같은 생물학적 개체 간의 진화적 관계를 나타내는 분기 다이어그램입니다. 각 분기점은 공통 조상을 나타내며, 분기 패턴은 계통이 시간에 따라 어떻게 갈라졌는지에 대한 가설을 반영합니다. 계통수는 비교 생물학, 역학, 보전 계획의 핵심입니다.

계통수는 일반적으로 최대우도, 베이즈 추론, 이웃 결합(neighbor-joining)과 같은 방법을 사용하여 분자 데이터(DNA, RNA 또는 단백질 서열)로부터 추론됩니다. 결과는 일반적으로 Newick 형식으로 저장되는데, 이는 중첩 괄호 텍스트 표기법으로 토폴로지와 선택적으로 진화적 거리에 비례하는 가지 길이를 인코딩합니다.

계통수 생성기는 해당 Newick 문자열을 가져와 출판이나 교육에 적합한 시각적 다이어그램으로 변환합니다. 이 도구는 동료 검토 문헌에서 가장 흔한 레이아웃인 직사각형 계통도(rectangular phylogram)를 선택적 가지 길이 주석과 축척 막대와 함께 렌더링합니다.

분기 진화 관계를 보여주는 계통수의 손그림 스케치
04비교

계통수 vs. 분지도

둘 다 진화적 관계를 보여주지만, 계통수와 분지도는 가지 길이가 나타내는 의미와 각각을 사용해야 하는 상황에서 차이가 있습니다.

계통수(Phylogram)

가지 길이는 진화적 거리에 비례

  • 가지 길이는 부위당 치환 수 또는 분기 시간을 나타냄
  • 정량적 비교를 위한 축척 막대 포함
  • ML, 베이즈, 거리 기반 방법의 표준 출력
  • 분자 계통학 및 유전체학 논문에서 선호됨
  • 서열 데이터와 정렬(alignment)이 필요함

분지도

가지 길이 균일 — 토폴로지만 표시

  • 거리와 관계없이 모든 가지가 같은 길이로 그려짐
  • 분기 사건의 순서에만 집중함
  • 형태 기반 또는 절약(parsimony) 분석에서 자주 사용됨
  • 교육 자료와 교과서 삽화에서 흔히 볼 수 있음
  • 분자 데이터 없이 종 목록만으로 구축할 수 있음
05작동 방식

이 생성기로 계통수 만드는 방법

원시 데이터에서 완성된 그림까지 4단계 — 소프트웨어 설치가 필요 없습니다.

  1. 01

    Newick 트리를 붙여넣거나 종 이름을 입력하세요

    계통학 소프트웨어(MEGA, RAxML, IQ-TREE, MrBayes)에서 Newick 문자열을 복사하여 텍스트 상자에 붙여넣으세요. 빠른 클래도그램만 필요하면 종 목록 모드로 전환하여 한 줄에 분류군 하나씩 입력하세요.

  2. 02

    표시 설정 조정

    가지 길이 라벨을 켜거나 끄고 잎 이름의 글꼴 크기를 설정하세요. 미리보기가 실시간으로 업데이트되므로 다시 내보내지 않고도 실험해 볼 수 있습니다.

  3. 03

    계통수 미리보기

    직사각형 계통도가 입력 패널 오른쪽에 표시됩니다. 트리에 분류군이 많으면 스크롤하세요. 보이는 그대로 내보내기에 포함되며 예상 밖의 결과는 없습니다.

  4. 04

    SVG 또는 PNG로 내보내기

    Illustrator나 Inkscape에서 편집할 수 있는 벡터 파일을 얻으려면 SVG 다운로드를 클릭하세요. 슬라이드, 포스터 또는 보충 자료에 사용할 수 있는 2배 해상도 래스터 이미지를 얻으려면 PNG 다운로드를 클릭하세요.

06FAQ

계통수 생성기 — 자주 묻는 질문

계통수와 이 도구로 계통수를 생성하는 방법에 대한 자주 묻는 질문입니다.

07관련 도구

나만의 계통수, 몇 초 만에 완성

Newick 문자열을 붙여넣거나 종 목록을 입력하고, 표시를 조정한 다음, 출판 준비가 된 계통수를 다운로드하세요 — 설치도, 가입도 필요 없습니다.

계통수 생성