Digita un elenco indentato di taxa o incolla notazione a parentesi, e questo creatore di cladogrammi disegna un diagramma ramificato ad angolo retto con ogni terminale allineato — il formato atteso nei corsi di biologia, pronto da esportare come SVG o PNG.
Quattro cladogrammi costruiti con questo creatore di cladogrammi, ciascuno mostrando un modo diverso in cui l'ordine di ramificazione comunica un'ascendenza comune.
Pesci, anfibi, rettili e mammiferi disposti secondo caratteri derivati condivisi — quattro arti, l'uovo amniotico, il pelo — ciascuno segnato nel punto di ramificazione in cui compare per la prima volta.
Un cladogramma da corso di botanica che raggruppa famiglie di angiosperme per ordine di ramificazione dedotto, costruito da un semplice schema indentato senza bisogno di dati molecolari.
Un cladogramma in stile manuale che separa teropodi, sauropodi e ornitischi, disegnato da notazione a parentesi incollata direttamente dagli appunti di lezione.
Un cladogramma compatto di grandi scimmie e primi ominini, con tutti i terminali allineati al bordo destro poiché qui la lunghezza dei rami non ha significato.
Un cladogramma è un diagramma ramificato che mostra il pattern dedotto di ascendenza comune tra un gruppo di organismi, senza affermare nulla su quanto tempo o quanto cambiamento evolutivo li separi. Ogni punto di ramificazione, o nodo, rappresenta un antenato comune ipotetico, e tutto ciò che sta a destra di quel nodo condivide un carattere derivato — una sinapomorfia — che gli organismi fuori dal gruppo non possiedono.
Questo è il dettaglio che confonde chi incontra per la prima volta il termine: in un cladogramma la lunghezza dei rami non ha significato. Due terminali disegnati lontani e due disegnati vicini possono essere ugualmente imparentati se si trovano alla stessa profondità di ramificazione. È diverso da un albero filogenetico (filogramma), dove la lunghezza dei rami è scalata sulla distanza molecolare o sul tempo di divergenza. Un creatore di cladogrammi disegna quindi ogni terminale allineato allo stesso bordo — una disposizione a scalinata, ad angolo retto — invece di estendere i rami su una barra di scala.
I cladogrammi sono costruiti a partire da caratteri: tratti morfologici, comportamenti o, nella pratica moderna, dati di sequenza molecolare ridotti a una topologia a massima parsimonia o massima verosimiglianza. Poiché il diagramma codifica solo la topologia, è il formato didattico standard per introdurre la cladistica — il metodo di raggruppare organismi in base a caratteri derivati condivisi anziché alla somiglianza complessiva — prima che gli studenti passino alle filogenesi con lunghezza dei rami.
Quattro passaggi da un elenco di taxa a un diagramma esportabile — nessun software di disegno necessario.
Digita uno schema indentato (un taxon per riga, un'indentazione più profonda indica un ramo più derivato) oppure incolla notazione a parentesi come (Fish,(Amphibians,Mammals)). Scegli quello che corrisponde a come è già scritto il tuo materiale di partenza.
Aggiungi un carattere condiviso tra parentesi quadre dopo il nome di un taxon — ad esempio, Amniotes [Amniotic egg] — e il creatore di cladogrammi disegna un piccolo trattino con etichetta a quel punto di ramificazione.
Il diagramma si aggiorna mentre digiti, con ogni terminale allineato allo stesso bordo. Correggi un clade fuori posto reindentando una riga o spostando un gruppo tra parentesi — nessuna coordinata da trascinare.
Scarica un SVG per un file vettoriale rietichettabile in Illustrator o Inkscape, oppure un PNG a 2× dimensionato per diapositive, dispense e relazioni di laboratorio.
I due diagrammi sembrano simili, ma la linea che li separa è se la lunghezza dei rami porta informazione — e questo cambia come vanno letti.
La lunghezza dei rami non ha significato — solo la topologia
Lunghezza dei rami proporzionale alla distanza evolutiva
La maggior parte di studenti e docenti non ragiona in parentesi annidate — ragiona per schemi. Digita un taxon per riga e indenta per annidare un ramo sotto il suo antenato; il creatore di cladogrammi deduce la struttura dell'albero dalla sola indentazione, così uno schema da appunti di lezione diventa un diagramma senza riformattazioni.
Per topologie profondamente annidate o copiate e incollate, la notazione a parentesi è più rapida da scrivere di uno schema. Il creatore di cladogrammi analizza il raggruppamento standard con parentesi annidate — nessuna sintassi di lunghezza dei rami da gestire, perché un cladogramma non la usa.
Un cladogramma è utile a fini didattici solo se mostra perché i lignaggi sono stati raggruppati. Associa un carattere derivato condiviso a qualsiasi nodo — quattro arti, un uovo amniotico, le piume — e il creatore di cladogrammi lo rende come un piccolo trattino con didascalia, esattamente dove il carattere sarebbe comparso per primo.
Domande comuni sui cladogrammi e su come costruirne uno con questo strumento.
Nessuna installazione, nessuna conversione di file — digita i tuoi taxa e scarica un diagramma pronto per una relazione di laboratorio o una lezione.