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Generatore di palette di colori scientifiche

Una palette di colori per figure scientifiche non dovrebbe richiedere una laurea in design per essere fatta bene. Crea set categorici, sequenziali o divergenti da Okabe-Ito, viridis, cividis e ColorBrewer, poi controlla ogni colore rispetto a deuteranopia e protanopia prima che arrivi a un revisore.

Palette
#000000 0,0,0 #e69f00 230,159,0 #56b4e9 86,180,233 #009e73 0,158,115 #f0e442 240,228,66 #0072b2 0,114,178 #d55e00 213,94,0 #cc79a7 204,121,167 Original Deuteranopia Protanopia
01COS'È

Cos'è un generatore di palette di colori scientifiche, e cosa sceglie per te?

Le palette categoriche (qualitative) assegnano una tinta distinta a ogni gruppo nei tuoi dati — bracci di trattamento, tipi cellulari, specie, condizioni sperimentali — dove l'obiettivo è distinguere le classi, non implicare un ordine o una grandezza. Un buon set categorico resta visivamente distinto a colpo d'occhio, anche per un lettore con deficit di visione dei colori rosso-verde, e si separa comunque bene quando un revisore stampa il tuo manoscritto in scala di grigi. Okabe-Ito, costruita appositamente per un design color-universal, e Set2 di ColorBrewer sono i due set categorici integrati in questo generatore di palette di colori scientifiche — ciascuno funziona anche da solo come palette accessibile ai daltonici.

Le palette sequenziali codificano una grandezza ordinata — livello di espressione, valore p, concentrazione, tempo trascorso — come una rampa graduale da basso ad alto, in genere da chiaro a scuro. Sono adatte a heatmap, grafici di densità e qualsiasi figura dove il colore rappresenta solo una grandezza. Viridis e cividis sono percettivamente uniformi: passi uguali nei dati producono passi di colore dall'aspetto uguale, così l'occhio del lettore non fraintende dove un gradiente cambia più rapidamente. ColorBrewer Blues, un set sequenziale a tinta singola in questo generatore di palette di colori scientifiche, svolge lo stesso compito con un intervallo più semplice.

Le palette divergenti sono per dati con un centro significativo — fold-change pari a zero, una linea di base di controllo, nessuna correlazione — con due direzioni che si diramano da esso. Heatmap di fold-change log2, matrici di correlazione e grafici di effect-size richiedono tutti uno schema divergente, così un lettore distingue "sopra la linea di base" da "sotto la linea di base" dalla tinta invece di scrutare i numeri sull'asse. RdBu di ColorBrewer mantiene rosso e blu ai poli opposti attorno a un punto medio neutro, il che resiste anche meglio alla stampa in scala di grigi rispetto a una coppia rosso-verde.

Tre righe di campioni che confrontano le strutture di palette di colori categorica, sequenziale e divergente
02ESEMPI

Palette integrate, rese come output reale

Ogni scheda qui sotto è l'esatto SVG che questo generatore di palette di colori scientifiche produce con le impostazioni predefinite — non un mockup.

Categorica: Okabe-Ito per confronti tra gruppi

Otto tinte universali per i colori che fungono anche da palette accessibile ai daltonici per bracci di trattamento, linee cellulari o etichette di specie — distinte in deuteranopia e protanopia, e ancora separabili se stampate in bianco e nero.

Sequenziale: Viridis per dati continui

Una rampa percettivamente uniforme dal viola scuro al giallo, ricampionata a qualsiasi numero di passi da 2 a 12 per heatmap e grafici di densità dove il colore codifica una grandezza.

Divergente: ColorBrewer RdBu attorno a un centro

Dal rosso al blu con un punto medio neutro, per heatmap di fold-change e matrici di correlazione dove i lettori devono vedere quali valori stanno sopra o sotto una linea di base.

Simulazione per daltonismo, affiancata

La stessa palette resa come appare con visione tipica, poi trasformata per deuteranopia e protanopia, così puoi individuare una collisione prima di un revisore.

03FUNZIONALITÀ

Tutto ciò che questo generatore di palette di colori scientifiche automatizza

Selettore di famiglia di palette che passa tra modalità categorica, sequenziale e divergente
Categorica · Sequenziale · Divergente

Un generatore, tre modi per codificare i dati

Passa tra categorica, sequenziale e divergente senza lasciare la pagina — scegli la famiglia che corrisponde a cosa significano davvero i tuoi dati, poi ottieni un set completo di colori per figure di ricerca costruito attorno ad essa.

Simulazione per daltonismo affiancata di una palette di colori scientifica
Deuteranopia · Protanopia

Simulazione per daltonismo integrata in ogni anteprima

Si stima che circa 1 uomo su 12 e circa 1 donna su 200 abbiano una qualche forma di deficit di visione dei colori rosso-verde. Questo controllo per palette accessibile ai daltonici esegue una vera trasformazione per deuteranopia e protanopia sui colori scelti e mostra tutte e tre le versioni affiancate prima di aprire il tuo software di plotting.

Controllo a cursore che regola il numero di colori in una palette scientifica da due a dodici
2-12 colori

Numero di colori regolabile, senza indovinare i codici esadecimali

Trascina da 2 a 12 colori e questo generatore di palette di colori scientifiche ricampiona dai punti di riferimento di ogni palette — i set categorici ciclano tra le loro tinte fisse, i set sequenziali e divergenti interpolano nuovi passi — così non stai mai a occhio con un gradiente disegnato a mano.

SVG esportato di una palette di colori con etichette esadecimali e RGB sotto ogni campione
SVG · PNG · HEX

Esporta direttamente nella tua libreria di plotting

Scarica un SVG o PNG etichettato per la legenda di una figura, oppure clicca su un campione per copiarne il codice esadecimale e incollare quei colori per figure di ricerca direttamente in matplotlib, ggplot2 o Prism — nessun selettore di colore separato richiesto.

04CONFRONTO

Perché colormap rainbow e jet falliscono nelle figure scientifiche

La colormap rainbow o jet predefinita dei software di plotting più vecchi compare ancora nei manoscritti inviati, e come palette di colori per figure scientifiche fallisce in due modi specifici e ben documentati.

Colormap Jet / Rainbow

  • Percettivamente non uniforme — passi uguali nei dati producono salti disomogenei, a volte invertiti, nella luminosità apparente, che possono far leggere un plateau come un picco.
  • Collassa verso una banda di grigio medio simile se stampata o fotocopiata in bianco e nero, cancellando l'intervallo che i lettori devono confrontare.
  • Confonde i lettori con deficit di visione dei colori rosso-verde, poiché i suoi segmenti rosso e verde stanno vicini con poco contrasto di luminosità tra loro.

Palette percettivamente uniformi, accessibili ai daltonici

  • Luminosità monotona — viridis e cividis aumentano la luminosità in una sola direzione, dando colori per figure di ricerca che si leggono correttamente senza dover prima decodificare la tinta.
  • Distinte in scala di grigi — i set ColorBrewer e Okabe-Ito sono costruiti e testati per la leggibilità dopo la conversione in bianco e nero.
  • Verificate contro i tipi comuni di deficit della visione dei colori, non solo controllate da un unico designer con vista normale.
05FAQ

Domande prima di scegliere una palette

Domande comuni da ricercatori che preparano figure per l'invio a una rivista.

06STRUMENTI CORRELATI

Dai alla tua prossima figura una palette che regge in revisione

Scegli una famiglia di palette in questo generatore di palette di colori scientifiche, controllala rispetto a deuteranopia e protanopia, e copia i codici esadecimali direttamente nel tuo script di plotting — costruire una palette accessibile ai daltonici richiede minuti, non un altro giro di commenti dei revisori.

Crea una palette